公訴轉自訴案件其實是對公安機關，檢察院行為的一種審查，是一種監督糾錯機制，它本質上仍是公訴案件，不可以反訴，只不過賦予了被害人自訴的救濟權利，因此是不允許調解的，除了民事賠償部分。
但是根據法律相關規定，可以進行和解。公訴轉自訴案件可以和解。
人民檢察院應當將複查決定告知被害人，對人民檢察院維持不起訴決定的，被害人可以向人民法院起訴。被害人也可以不經申訴，直接向人民法院起訴。人民法院受理案件後，人民檢察院應當將有關案件材料移送人民法院。
【法律依據】
根據《刑事訴訟法》第180條規定：對於有被害人的案件，決定不起訴的，人民檢察院應當將不起訴決定書送達被害人。被害人如果不服，可以自收到決定書後七日以內向上一級人民檢察院申訴，請求提起公訴。
