甲乙父子可以約定斷絕父子關係嗎

不能約定，因為違背了公序良俗。民事主體有權依照自己的意願作出一些決定，按照自己的意願從事一定民事活動。但是，民事主體從事民事活動不能違反法律，不能違背公序良俗。甲乙父子約定斷絕父子關係的行為，違背了一般的道德準則和倫理要求，不符合公序良俗，因此不可以。
《中華人民共和國民法典》第八條民事主體從事民事活動，不得違反法律，不得違背公序良俗。