有。
1、只要不違反法律的禁止性和限制性規定,且充分尊重當事人雙方的意思自治，協議內容合法有效的話，補充協議與主合同的效力是同等的。
2、在補充協議與主合同發生衝突時，視為對主合同的變更或撤消，其效力優於主合同。即補充合同中與主合同相沖突的條款，補充協議的條款優先適用。
3、雙方需要在補充協議中明確補充原合同的效力範圍，明確補充主合同是在原來的範圍之內生效還是有所變動、如何變動等。
4、補充協議是以主合同的成立和有效為前提的，如果欠缺主合同成立的必備條件和必要條款，或者主合同被確認無效或者被撤銷，就沒有簽訂補充協議的必要了。
《民法典》第四百六十五條 依法成立的合同，受法律保護。
依法成立的合同，僅對當事人具有法律約束力，但是法律另有規定的除外。
