稅收風險是指企業在遵從稅法時的實際表現與應該達到的實際標準之間存在差異進而導致損失的不確定性。主要分為三大類：
1、多繳稅款風險。
經營行為適用稅法不準確造成企業應享受而未享受相關稅收優惠政策、錯誤適用稅率多繳稅款或應抵扣未抵扣進項稅金等，使企業承擔不必要的稅收負擔和經濟損失，並直接影響利潤總額。
2、少繳稅款風險。
企業的納稅行為不符合稅收法律法規的規定，應繳稅而未繳稅、少繳稅或未能準確界定增值稅進項稅的抵扣範圍或違規操作抵扣，均存在被稅務機關查處後補繳稅款，加處罰款和滯納金以及聲譽損害等風險。
3、發票管理風險。
企業最大的發票管理風險是虛開發票風險。由於增值稅專用發票具有抵扣稅款的功能，因此虛開增值稅專用發票不僅是發票管理辦法和增值稅專用發票使用規定嚴厲禁止的行為，也是刑法要嚴懲的犯罪行為。企業發票管理不善，就可能出現虛開發票或取得虛開發票的情況，從而帶來違法犯罪風險及多繳稅款的風險。
