1、計稅：
零稅率：零稅率是在計算繳納增值稅時，銷項稅額按照0%的稅率計算，進項稅額允許抵扣。
免稅：增值稅中的免稅只是免去某一生產、流通環節的稅款，其他各環節稅款則不能免除，且進項稅額不允許抵扣。
2、核算：
零稅率：實行零稅率的其進項稅額允許抵扣，涉及進項稅額的退還。同時，銷售零稅率的貨物，其銷售額計入全部銷售額，銷項稅額為0。因此，零稅率貨物進項稅額需要進行核算，銷項稅額不需要進行核算。
免稅：進項稅額不允許抵扣，會計核算中進項稅額直接計入貨物的成本。銷售免稅貨物，只能開具普通發票，其收入計入銷售收入，不計算銷項稅額。因此，免稅貨物的進項稅額與銷項稅額都不需進行核算。
3、管理：
零稅率：零稅率是增值稅的一檔稅率，只要符合檔案規定，就可以適用零稅率，無須稅務機關審批或備案。
免稅：免徵增值稅屬於稅收優惠，要按照稅收優惠管理的相關要求，或先經稅務機關審批，或報送稅務機關備案。
第三十七條
增值稅起徵點的適用範圍限於個人。 增值稅起徵點的幅度規定如下： (一)銷售貨物的，為月銷售額5000-20000元;(二)銷售應稅勞務的，為月銷售額5000-20000元; (三)按次納稅的，為每次(日)銷售額300-500元。前款所稱銷售額，是指本細則第三十條第一款所稱小規模納稅人的銷售額。省、自治區、直轄市財政廳(局)和國家稅務局應在規定的幅度內，根據實際情況確定本地區適用的起徵點，並報財政部、國家稅務總局備案。
