分公司註銷了還可以起訴嗎

可以的，應以從公司取得清算資產的股東為訴訟主體。公司被註銷後，如未進行清算或者破產的，以該公司的股東、發起人或者出資人作為當事人。公司經過清算或者破產程序的，公司債務視為處理完畢。如有未了結的債務，應以從公司取得清算資產的股東為訴訟主體。
《最高法院關於民事訴訟法的解釋》第六十四條：企業法人解散的，依法清算並註銷前，以該企業法人為當事人；未依法清算即被註銷的，以該企業法人的股東、發起人或者出資人為當事人。