區別如下：
1、概念方面的區別：非法吸收公眾存款罪是指違反國家金融管理法規非法吸收公眾存款或變相吸收公眾存款，擾亂金融秩序的行為。非法集資罪是指以非法佔有為目的，使用詐騙方法非法集資，數額較大的行為。
2、從主觀故意來看，非法集資具有非法佔有的主觀故意；而非法吸收公眾存款罪行為人沒有非法佔有的故意。
3、從客觀行為來看，非法集資通常是採用虛構事實、隱瞞真相等方式，集資的欠款非法佔有，用於個人揮霍、個人私利使用；非法吸收公眾存款是為了用於生產經營，並且實際上全部或者大部分的資金也是用於生產經營；
4、從造成的社會後果來看，非法集資往往造成集資款項揮霍殆盡，無法償還，造成社會不穩定；非法吸收公眾存款，則會有實際投資專案等，通常都是可以償還的，只是違反了國家的金融管理秩序。
《最高人民法院關於審理非法集資刑事案件具體應用法律若干問題的解釋》第三條 非法吸收或者變相吸收公眾存款，具有下列情形之一的，應當依法追究刑事責任：
（一）個人非法吸收或者變相吸收公眾存款，數額在20萬元以上的，單位非法吸收或者變相吸收公眾存款，數額在100萬元以上的；
（二）個人非法吸收或者變相吸收公眾存款物件30人以上的，單位非法吸收或者變相吸收公眾存款物件150人以上的；
（三）個人非法吸收或者變相吸收公眾存款，給存款人造成直接經濟損失數額在10萬元以上的，單位非法吸收或者變相吸收公眾存款，給存款人造成直接經濟損失數額在50萬元以上的； （四）造成惡劣社會影響或者其他嚴重後果的。
具有下列情形之一的，屬於刑法第一百七十六條規定的“數額巨大或者有其他嚴重情節”：
（一）個人非法吸收或者變相吸收公眾存款，數額在100萬元以上的，單位非法吸收或者變相吸收公眾存款，數額在500萬元以上的；
（二）個人非法吸收或者變相吸收公眾存款物件100人以上的，單位非法吸收或者變相吸收公眾存款物件500人以上的；
（三）個人非法吸收或者變相吸收公眾存款，給存款人造成直接經濟損失數額在50萬元以上的，單位非法吸收或者變相吸收公眾存款，給存款人造成直接經濟損失數額在250萬元以上的； （四）造成特別惡劣社會影響或者其他特別嚴重後果的。
非法吸收或者變相吸收公眾存款的數額，以行為人所吸收的資金全額計算。案發前後已歸還的數額，可以作為量刑情節酌情考慮。
非法吸收或者變相吸收公眾存款，主要用於正常的生產經營活動，能夠及時清退所吸收資金，可以免予刑事處罰；情節顯著輕微的，不作為犯罪處理。
