1、主體不同：申請執行是當事人向人民法院申請強制執行，強制執行是人民法院決定適用強制執行的程式和措施。
2、法律效果不同：申請執行只是申請人向法院已提交的保護自身利益的申請。強制執行則是法院根據當事人的申請而做出的有效方法來保證申請人的利益。
《民法典》第八條，民事主體從事民事活動，不得違反法律，不得違背公序良俗。
法律依據：商務行政處罰程式規定 第五十一條
當事人逾期不履行行政處罰決定的，作出行政處罰決定的商務主管部門依法強制執行或者申請人民法院強制執行。申請人民法院強制執行前，可以向當事人發出要求其履行義務的書面催告。催告發出10日後當事人仍未履行的，申請人民法院強制執行。
