環境汙染適用的是侵權舉證倒置規則。舉證責任倒置，是指法律直接規定的侵權訴訟案件中，由侵權人負責舉證，證明與損害結果之間不存在因果關係或受害人有過錯或者第三人有過錯，也就是是將通常情形下本應由主張權利的一方當事人(一般是原告)就某種事由存在與否不負擔舉證責任,而轉移由對方當事人(一般是被告)就某種事實存在或不存在承擔舉證責任,若是對方當事人不能提供證據證明事項的存在或不存在,則推定原告的事實主張成立的一種舉證責任分配製度。
在一般的民事侵權訴訟中，如果原告不能提供充足的證據證明其請求成立，則要承擔敗訴的風險，而鑑於環境汙染侵權的複雜性和實體公正性的考慮，世界上大多數國家在環境汙染侵權訴訟上都採用舉證倒置原則，我國亦如此。
因環境汙染引起的損害賠償訴訟，由加害人就法律規定的免責事由及其行為與損害結果之間不存在因果關係承擔舉證責任。在環境汙染責任一章中將此種因果關係舉證責任倒置的規定予以強化，因汙染環境發生糾紛，汙染者應當就法律規定的不承擔責任或者減輕責任的情形及其行為與損害之間不存在因果關係承擔舉證責任。
舉證責任倒置規則適用到環境侵權中，具體是指因果關係的倒置，即由汙染者承擔因果關係不存在的證明責任。在環境汙染侵權訴訟中，其因果關係的認定比一般民事侵權案件中的因果關係認定要困難的多，為了保護環境和受害者的利益，一些國家規定在環境汙染訴訟中，採取因果關係推定原則，只要加害人不能舉證證明汙染事實不存在，即推定汙染損害因果關係成立，加害人依法應承擔侵權的賠償責任。
在訴訟侵權案件中，一般都是誰主張誰舉證，但是一些特殊情況下，受害人舉證困難，環境汙染案件就是其中之一。環境汙染侵權舉證責任倒置規則是由侵權人負責舉證，證明與損害結果之間不存在因果關係或受害人有過錯或者第三人有過錯，是一種責任分配製度，是考慮到環境汙染侵權的複雜性和實體公正性而設定的。
