工程保證金合同的主要內容是：寫好委託方的基本資訊，開戶行，建設單位以及約定的事項包括哪些；比如：甲方委託乙方為丙方開設建設工程“質量保證金”專戶，丙方按施工合同中保證金約定條款將“質量保證金”，存入乙方等。
法律依據
《中華人民共和國招標投標法實施條例》
第二十六條
招標人在招標檔案中要求投標人提交投標保證金的，投標保證金不得超過招標專案估算價的2%。投標保證金有效期應當與投標有效期一致。依法必須進行招標的專案的境內投標單位，以現金或者支票形式提交的投標保證金應當從其基本賬戶轉出。招標人不得挪用投標保證金。
