1、對稅收風險管理的意識淡薄，不夠重視。
一直以來，企業決策層往往重視經營風險管理，而對於稅務管理，決策層往往將其歸於財務部門計提和繳納的職責，普遍認為只要不做假帳就不存在稅收風險，很少有人從戰略層面考慮稅收風險。
2、企業稅務管理組織建設和稅收風險內控機制不到位。
主要表現為：未設定獨立的稅務管理機構或稅務管理專職崗位，稅務管理職能主要由財務人員兼職;沒有建立獨立完善的稅收風險管理制度，只是在公司財務風險管理、財務內部控制等管理制度中作了簡單規定，僅只簡單涉及稅收風險管理方面的幾個條款。
3、稅務溝通協調不夠。
由於涉稅事項經辦人員對稅收政策掌握不全，對稅務機關的徵管方法或稅務危機處理缺乏專業瞭解，在應對稅務機關日常檢查和稅務稽查過程中，始終處於被動地位，不能及時提出合法合理反駁意見和妥善處理相關問題的建議，與稅務機關之間的溝通往往難以達到預期的效果，無法化解自身稅務危機。在重大涉稅事項上，也無尋求稅務機關的輔導和幫助的意識，一些本可以預先化解的潛在稅務危機，也因與稅務溝通協調不夠，而變成現實的稅收風險。
4、稅收新政對涉稅業務處理等提出了新要求。
“營改增”全面推行以來。由於營業稅是對營業額直接徵稅，核算模式簡單易懂。而增值稅採用進項抵扣的核算模式，核算難度較原來大幅增加。而且，“營改增”不僅改變了企業的整個涉稅核算體系，同時還帶來了開票系統、報稅系統、認證抵扣、稅款繳納等操作方面的一系列新問題，營業稅背景下的簡易核算模式已遠遠不能適應增值稅政策的相關要求，涉稅業務處理稍有不慎便會產生稅收風險。
