首先在無特別約定的情況下，無論公司是否設定有股東名冊，股東轉讓出資是否在股東名冊上進行登記的，不影響股權轉讓的法律效力。不過，雖然這時出資的轉讓在股東之間有效，但其股權轉讓是否具有對抗公司及第三人之效力，須具體情況具體分析。
在因公司之過錯，而未在股東轉讓出資後對股東名冊進行變更登記的情況下，無論股東名冊是否進行了變更登記，公司均應依照出資已轉讓後的新情況，進行會議通知、利潤分配等活動。同時，公司應依法對股東名冊進行相應變更。否則，公司應當承擔因此給受讓股東造成的損失。
無論何種原因造成股東轉讓出資後，未對公司股東名冊進行變更登記，在依法對股東名冊進行變更登記之前，股權的轉讓均不具有對抗善意第三人的效力。如善意第三人因此受到經濟損失，有權向過錯方追索賠償。
法律依據：
《中華人民共和國公司法》第三十二條
有限責任公司應當置備股東名冊，記載下列事項：
(一)股東的姓名或者名稱及住所;
(二)股東的出資額;
(三)出資證明書編號。
記載於股東名冊的股東，可以依股東名冊主張行使股東權利。
公司應當將股東的姓名或者名稱向公司登記機關登記;登記事項發生變更的，應當辦理變更登記。未經登記或者變更登記的，不得對抗第三人。
