自然人股東股權轉讓應繳納以下稅收
1、個人所得稅：以轉讓人為納稅人，以受讓人為扣繳義務人。股權轉讓所得，以股權轉讓的收入減除股權計稅成本和合理費用後的餘額為應納稅所得額，按照“財產轉讓所得”稅目申報繳納個人所得稅，稅率為百分之二十。
2、印花稅：股權轉讓合同書立雙方涉及自然人的，應以自然人為納稅人，就合同所載金額按照按照“產權轉移書據”稅目申報繳納印花稅，稅率為萬分之五。
辦理納稅(扣繳)申報的時間是：簽訂股權轉讓協議並完成股權轉讓交易的，轉讓方或受讓方應在企業變更股權登記之前，到主管地稅機關辦理納稅(扣繳)申報。
根據您提供的資訊，股權轉讓行為已完成，應到儘快到主管稅務機關申報補繳各項應納稅款。
股權轉讓收益如何繳所得稅等相關問題如上所述。我們可以得知的是企業在繳納所得稅或者是印花稅的時候需要按照有關的規定進行，比如印花稅暫行條例等等，個人在進行股權轉讓的時候也是需要進行一定的手續的，需要個人自行申報需要交納的個人所得稅，如果發生漏繳少繳的情況應該及時的補齊。
