摩托車醉駕不會扣小車照，由於違反的是駕駛摩托車的有關規定，因此只會扣摩托車駕照。摩托車與小汽車相同，都屬於機動車型別，如果飲酒後駕駛機動車的，處暫扣六個月機動車駕駛證，並處一千元以上二千元以下罰款。醉酒後駕駛的，直接吊銷機動車駕駛證，依法追究刑事責任。
目前法律規定中，摩托車駕駛證和C1駕駛證合併後，每個記分週期內共用12分，那麼飲酒後駕駛，扣12分，罰款1000到2000元，暫扣駕駛證6個月，就不再分摩托車或者小車駕駛證了。在暫扣期間，無論駕駛人是駕駛摩托車還是小車都屬於無證駕駛。
從外，如果醉酒駕駛摩托車的當事人沒有摩托車駕駛執照，即便是有小車駕照也屬於無證駕駛，屬於駕駛車型與準駕車型不符，無證駕駛摩托車會被罰款或拘留。駕駛摩托車，應當依法取得準駕型別相符的摩托車駕駛證(三輪摩托車D、二輪摩托車)。在18週歲以上，60週歲以下，可以申領普通二、三輪摩托車駕駛證。
相關法律依據：
根據《中華人民共和國道路交通安全法》第九十一條飲酒後駕駛機動車的，處暫扣六個月機動車駕駛證，並處一千元以上二千元以下罰款。因飲酒後駕駛機動車被處罰，再次飲酒後駕駛機動車的，處十日以下拘留，並處一千元以上二千元以下罰款，吊銷機動車駕駛證。醉酒駕駛機動車的，由公安機關交通管理部門約束至酒醒，吊銷機動車駕駛證，依法追究刑事責任;五年內不得重新取得機動車駕駛證。飲酒後駕駛營運機動車的，處十五日拘留，並處五千元罰款，吊銷機動車駕駛證，五年內不得重新取得機動車駕駛證。醉酒駕駛營運機動車的，由公安機關交通管理部門約束至酒醒，吊銷機動車駕駛證，依法追究刑事責任;十年內不得重新取得機動車駕駛證，重新取得機動車駕駛證後，不得駕駛營運機動車。
綜上所述，雖然醉酒後駕駛摩托車不會扣小車執照，但是現在小車執照和摩托車執照已經合併了，如果當事人只有摩托車照則扣押摩托車照，如果是小車駕照和摩托車駕照合併使用，則同時被吊銷並罰款，作為一個司機一定要做到開車不喝酒，喝酒不開車，文明駕駛這也是對自己的家人負責。
